(一) 气功功法的研究
气功这一名词，据考证，是新中国成立以后才有的，此前并无此名。据说此名与河北省的刘贵珍有关。他曾通过练内养功的方法，治好了自己的胃溃疡病，受到河北省及唐山市有关方面重视，并推广这一方法以治疗各种慢性疾病。这一情况也逐渐有关卫生部门的注意，当1955年12月卫生部创建中国中医研究院时，对刘贵珍推广这一治疗方法进行了表彰。次年，刘贵珍就在我国第一所气功疗养院，北戴河气功疗养院任院长。气功这一名词就此传播开来，，并成为一个正式的名词推广应用。
五、六十年代可以说是气功传播的初期，主要在临床中应用，大多用于治疗各种慢性疾病。
十年“文革”可以说是气功遭难磨劫的停滞阶段，由于这一学科的特殊性，加上社会上有少数人混水摸鱼，使气功的声誉受到一定的影响，这一学科在“文革”中被归入“四旧”的范畴，真正的气功科学也受到严重的摧残，其发展处在低潮。
“文革”结束以后，各地的气功研究所、室纷纷恢复重建，也有一些新建的部门，气功科学走上了正常发展的道路，七十年代末及八十年代上半期，气功科学上出现了一种新的现象，即认为气功练功师能发放外气，并以之治病的观点。如1979年，《自然杂志》首先刊登文章，提出外气的物质基础是“微粒流”、“红外辐射”，是一种电磁波，低频磁倍号等，认为这就是外气的科学依据。此后，这种研究逐渐普遍起来。全国各地有不少科研工作者不仅对传统气功治病进行研究，还对外气的科学根据作了不少实验研究，1988年在我国召开了“第一届国际医学气功学术讨论会议”。国内气功，流派林立，仅北京就有多种气功学术团体成立，全国更难计其数，气功单位截止89年至少已有80个，有代表性的气功刊物至少也有8种。
在八十年代末期在国内一些影响较大的传媒都刊登某些大学、研究机构或著名人物，均进入末认为外气具有物质基础的争鸣园地，与此相对立的是有些研究者反对气功有所谓外气的存在，并把这种外气为“伪气功”，认为所谓“外气”治病，纯属心理暗示。这就形成了气功学界两种不同的学术观点，双方观点尖锐对立，直到目前，其争论仍在继续。
八十年代以来，与对气功外气是否存在的争论相陪伴而出现的种种现象，如耳朵认字、特异功能、远距离发气可改变物质分子结构或治病、以及大规模万人以上的带功治病等等，在社会上也有一段颇为盛行，其中也不免夹杂一些社会渣滓，借“气功治病”混水摸鱼，暴敛钱财的江湖骗子。九曲黄河，泥沙俱下，使得对气功学术争鸣的潮流平添几分复杂性。这就是八、九十年代我国气功学的现状。
(二)气功的临床应用
最初，气功主要用于治疗消化性溃疡、胃下垂、高血压病、冠心病等，还有用于肺结核、支气管哮喘和青少年近视眼的。对某些慢性疾患还曾获得较理想的效果。对消化性溃疡，开始时，一般以症状及X射线钡餐检查评定疗效，有的报告提到龛影消失、症状改善，临床有效率达98.3%，龛影消失率82%，临床治愈率为77.4%，无效者仅1.7%。对于胃下垂，也曾有报告在五年间观察252例用气功治疗，发现患者治疗后的胃张力普遍好转。胃的位置也有不同程度的上升，平均上升6.35cm，个别病例完全复原。对高血压病患者，多数研究系以气功做为综合治疗中的一种疗法，发现对血压具有降低及稳定作用并能巩固疗效。对照研究表明，凡进行气功锻炼治疗者比不接受气功组的患者，在随访四年的观察中，气功组疗效保持在86.6%~95.6%之间，而对照组逐年下降，仅有70.7~76.7%患者有效。气功锻炼还具有预防脑卒中的作用。如有报告对294例原发性高血压从六十年代以气功开始治疗，随访达15~22年之后发现，气功组总的死亡率(由于脑卒中)为19.3%，而未进行气功锻炼对照组则为41.7%。气功锻炼具有明显的预防脑卒中的作用。
气功对冠心病治疗的研究，也是起于六十年代，认为气功锻炼有助于减少冠心病患者心绞痛的发作。对肺结核患者，练功也可使结核病灶减轻，进步率可达到58%。
以上是文革前应用气功对一些常见临床慢性病治疗的情况。十年内乱中，对气功的研究基本上陷于停顿，更有把气功作为落后守旧的对象批判者。
改革开放近二十年来，全国各地气功组织不断成立，甚至遍及国外及港台地区；气功刊物遍地开花，治疗机构和研究单位不断增加。影响较大的气功机构如上海气功疗养院、北戴河气功疗养院、杭州钱江气功医院、北京中医学院气功研究所，各中医学院多设有气功室，研究机构也多设有气功研究室(科)，刊物较有影响的也不少，如《气功》、《中华气功》、《中国气功》、《东方气功》、《气功与科学》……多达数十种。气功治疗各种疾病，在临床各科也继续深入发展。有人对气功在乙型慢性肝炎患者HBsAg阳性者，练功2-8个月，十例中八例阴转，说明气功治疗这方面正在深入；其他如呼吸系统疾病、青光眼、近视眼等，也都有不同程度的进展。
