一、医学教育体制与管理制度
南京政府成立后，1928年教育部曾委派一个委员会研究医学教育问题，该委员会曾拟定了一份关于今后10年的医学教育规划，其主要内容谈到应设立两种类型的教育机构，即医学院和医学专科学校。前者培养较高级的医务工作者，专门从事研究的人才，而后者培养一般的专业医师和实用卫生的人才。1929年，教育部与卫生部共同组织成立医学教育委员会和助产、护士等专业教育委员会，负责制定医学、助产、护士学校的课程，厘定学制及订立课程标准等，以提高医学教育水平。
1930年2月，医学教育委员会举行首次会议，赞成1928年教育部拟定的医学教育规划，并提出规划应作进一步修改完善。考虑到当时国内尚缺乏这方面的专家，故请求国际联盟派专家来中国帮助解决这个问题。1930年9月，国际联盟派哥本哈根大学的费伯(FaberK．)教授来中国协助教育委员会开展工作。费伯在中国进行了3个月的调查后，对中国医学教育、医学校的现状及今后的方针等问题提出了一个详细的报告。指出，当时中国的西医师约有4～5千人，平均8～10万人中才有一名医生，若要达到每8千人中有一名医生，则应迅速培养出5万名医生来。报告还指出，只有13所医学校能提供训练良好的医学生，但对于尽量培养大批医务人员来解决中国缺乏医生就显得太不够了。因此，费伯赞成兴办一批独立的医学专门学校，最好每省有一所，并建议先建立一所实验性或示范性医专学校，不宜采用外国标准，以便适应中国的疾病情况和经济状况，医学教育委员会于1931年决定采纳费伯的建议，并作了相应的安排。
二、医学院校的发展
南京政府成立后至抗日战争前，即1927～1937年间，国民党政权处于相对稳定状态，社会经济得到了一定的发展，医疗卫生工作及医学教育也取得了一些进步。这一方面是由于国民政府认识到了发展医药卫生事业在国民经济中的重要作用，另一方面是受过现代医学科学训练的中国医务工作者的队伍已经形成。相当一批留学海外的知识分子抱着“科学救国”、“教育救国”的心愿回到祖国，积极努力工作，对医学教育的发展有着重要影响。在这段时期内，我国自办的医学校，无论是国立或省立者都有较大的发展，为中国的医疗卫生事业培养了一批人才。
1927年上海建立的第四中山大学医学院(1932年改名为上海医学院)是国人自己创办的最有代表性的一所学校。1928年河南创办河南省立中山大学医(1930年秋改称河南大学医学院)。1932年甘肃兰州创建甘肃学院医学专修科(1946年改建为兰州大学医学院，1954年改称兰州医学院)。1932年济南成立山东医学专科学校(1939年改名山东医学院，1948年由白求恩医学院接收)。1934年镇江创建江苏医政学院(后定名为南京医学院)。1934年广西南宁创建广西省立医学院(1949年改名为广西医学院)。1936年南京建立国立药学专科学校(现南京药科大学前身)。1936年西安成立陕西省立医药专门学校(1949年并人西北医学院)。1937年昆明创办云南大学医学院(1956年改称昆明医学院)。1937年6月福州设立福建省立医学专科学校(1949年改名为福建医学院)，1938年3月贵阳建立贵阳医学院。此外还有许多大学办有医预科，如国立北京大学、国立南京中央大学、私立北平辅仁大学、济南齐鲁大学、上海圣约翰大学等。
据1937年教育部医学教育调查统计，当时全国有公私立大学医学院，独立医学院，医药、牙科学校及专修科总计33所。其中国立4所，省立7所，私立6所，教会办8所，外人办4所，军医学校2所，不详者2所。
南京国民政府时期，教会医学院校及外人所办的医学院校，在我国的医学教育中仍占有重要作用，虽然当时国内掀起收回教育主权的爱国运动，至30年代教会办的医学院校迫不得已纷纷在国民政府教育部立案注册，推荐中国籍教师担任校长，但这只是表面上由国民政府管辖，实权仍掌握在外人手中。因为教会学校和外人所办的学校受到外国财团的支持，具有经济实力。据1936年资料，美国教育及救济机关在中国的总投资为4190万美元，其中医药和教育费用占52.9%。1936年左右，全国30几所医学院校经费共为8,735,068元，而外人设立的协和医学院等3所医学院校的经费竟占6,201,015元。
抗日战争时期，医学教育事业遭到严重破坏。由于日军的入侵，大部分国土沦陷，许多被侵占地区的医药院校被迫停顿或内迁，教学仪器设备损失惨重，许多学校无法维持正常教学，内迁后与内地学校临时合并，组成联合学校。抗日战争胜利后，内迁学校纷纷复员回原址并陆续复课。同时还新建了一些医学院校，如1947年在汉口建立武汉大学医学院，同年在太原成立山西大学医学院。但是由于国民党政府已摇摇欲坠，忙于打内战，社会经济已频于崩溃，教育经费匮缺，医药教育事业日趋衰落，处于每况愈下的境地。
三、东北沦陷区的高等医学教育
1932年日军侵占东北，他们为了控制东北地区的命脉，掠夺东北的资源与奴役中国人民，曾在东北地区作了一番煞费苦心的经营。他们一方面加强原先创办的学校，同时又新办了一些医学校；另一方面，他们着意把自己的势力渗透到东北地区其它的医学校，以便达到操纵控制整个东北地区的医学教育大权。
日本人设立的医学校
日本为培养在南满铁路工作的医师，1911年即在沈阳建立了南满医学堂，日人河西健次为堂长。这是我国东北最早的高等医学校。1922年改为满洲医科大学，学制7年。1926年增设4年制医学专门部，专招中国学生，并许可中国女生入学。日本设在我国大连的统治机构关东州厅，为向日本移民“开拓团”提供医师，1939年，以旅顺医院为基础，建立旅顺医学校。1942年日本文部省命令学校改称旅顺医学专门学校。1940年，为日本屯垦移民培养医师，在哈尔滨及佳木斯分别开设开拓医学院。前者无专设机构，附设在哈尔滨医科大学内；后者在佳木斯新建校址与附属医院，1941年改名佳木斯医科大学。另外还有齐齐哈尔开拓医学院，龙井开拓医学院。
东北地区伪满的医学校
1928年在吉林省官医院的基础上创办吉林省立医学校。1930年至1932年、因沦陷造成学校经费困难，停办两年。1932年由吉林省公署接管，吉林省医院院长青木大勇兼任校长。1937年3月，学校迁至长春，由伪满文教部直辖、改校名为新京医学校。1938年，依据伪满＜大学令＞改称新京医科大学。1942年接管奉天药剂师养成所，1945年改称新京医科大学药学部，仍设在沈阳。1932年，伪满政权接管中东铁路，在哈尔滨成立北满铁路护路军军医养成所，学制3年。1934年由伪满军政部接管，改为陆军军医学校。
东北地区的教会医学校
1912年创办的奉天医科大学，是由英国苏格兰教会派遣的宣教医师司督阁(Dr. DouglesChristie)所创设的盛京施医院的基础上创办的。1917年8月，呈请北京教育部立案，改称奉天医科专门学校。1929年，改称辽宁医科专门学校，学制改为7年。1938年据伪满＜大学令＞改称盛京医科大学，学制改为5年。1941年太平洋战争爆发，西方教师撤走，教师全由中国人承担。1945年4月改为伪满国立。1945年冬，国民党政府接管，改名辽宁医学院。1948年11月沈阳解放，改名辽宁医科大学，1949年6月并如中国医科大学。
东北地区国人自办的医学校
1920年东北地区再度流行肺鼠疫，设东北防疫处于哈尔滨，领导东北全面防疫工作。东北防疫处总医官林家瑞提拟由中国自办医学校，培养医师以应需要。经东省特别区长官公署批准，于1926年建立哈尔滨医学专门学校，伍连德任校长。1938年根据伪满＜大学令＞改称哈尔滨医科大学。1939年接管由俄侨私立第一、第二齿科医学校合并成立的哈尔滨齿科医学院，1940年改编学校建制为医学部(4年制)与齿科医学部(3年制)。
东北地区的医学院校，还有1919年在辽阳医学讲习所基础上建立的辽阳医学校，1923年停办。1922年在沈阳成立的奉天同善堂医学校，1932年停办。1944年成立锦州医学院。仅招收三期学生，皆未及毕业。1945年春，以满铁大连医院为基础设立大连女子医学专门学校，只招一期日本学生，不久日本投降，学校随之解散。1946年苏联红十字新月协会在哈尔滨设立医学专科学校，张继有、张明峻在长春创办东方医学院，均维持不久即停办。
东北地区的西医教育，在日帝、沙俄势力角逐时期，几乎当时所有的医学院校直接受到外国的控制与影响。尤其是日本帝国主义侵占东北后，东北人民经受了14年的殖民奴役，多数医学院校直接由日本人管理办学。中国人民对于帝国主义的侵略是深恶痛绝的。但是，不能说东北地区医学教育都是为帝国主义服务的，在这些学校培养出来的中国医务人员，其中有不少人后来投身于革命，为我国的医学事业做出了贡献；有的人从事医疗、教学活动，做过许多有益的工作。
