我国近代西医学教育，大致可分为三个阶段：一、晚清时期：(1840～1911)自鸦片战争至辛亥革命前夕，这一时期处于满清封建王朝的统治下，同时帝国主义以医药作为侵略工具，将西方医药学知识传入我国，对我国医学的发展产生了影响。二、北洋政府时期：(1911～1927)我国没有完善的医学教育系统，在华教会设立的医学校由各教会系统所管辖，不受北洋政府教育主管部门的监督与管辖。这一时期颁布了医学教育的学制、章程等，主要是抄袭国外尤其是日本的学制，同时加入了中国体制的内容，规定了修业年限与必修科目，为其后医学教育的现代化准备了条件。三、南京国民政府时期：(1927～1948)南京政府成立后，确立了卫生行政体制。1929年12月教育部与卫生部共同组织成立医学教育委员会，对医学校的学制、课程、考试办法等拟定标准。这一时期系统地吸收了西方医学与教育的内容，新教育体制确立，各式新形医学校纷纷出现，开始进入近代医学教育体制。
一、早期西医人才的培养
1900年以前，西医人才的培养与教会医院有密切关系。传教士医师为了医疗上的需要，在医院或诊所招收中国学徒，教以浅简的医学知识，目的是训练担任护理助手工作，所以早期的西医教育是在医院内，以师带徒的方式进行。
19世纪初，东印度公司的皮尔逊医生来华后，在广州、厦门设立医药局。1806年开始招收华人学医。1837年伯驾在眼科医局招收学徒，关韬在伯驾手下学习，是我国最早学习西医者。此后各教会医院陆续开始招收学徒。据1887年尼尔调查，当时教会医院培养的生徒数量很少，在60所教会医院中，有39所兼收生徒，其中有5所招生人数超过10人，其余为2～6人，当时已毕业的约300名，肄业生约250～300名。这种学徒式的训练方法成效不高，很难算得上是正规的医学教育，而且培养出来的人不能满足当时医疗上的需要。
二、教会医学校的设立
由于西医基础理论知识的不断丰富，诊治技术的不断发展，欲将西医全部内容教授给学生，即将医学作为一门独立的知识体系在中国介绍、宣传、学习，师徒的传授方式已不适宜。同时，19世纪中叶至20世纪初，在华的传教医师和专职医师日见增多，设立学校，开展系统的西医教学在客观上具备了条件。在华的各教会组织为了使西医知识的传授纳入正常轨道，开始设立医学校。
最早的教会医学校博济医学校。成立于1886年。继博济医学校后，1884年美国安立甘会于抗州成立广济医学校。1887年英国伦敦会于成立爱丽斯纪念医院，并于同年8月成立医学校(香港西医书院，香港大学医学院的前身)，第一届有两名毕业生，其中之一是孙中山先生。1889年南京成立斯密纪念医院医学校。1890年济南成立济南医学校。1891年美国监理会在苏州成立苏州女子医学校。1894年成立苏州医学校(苏州女子医学校并入，1910年停办)。1896年，美国圣公会在上海圣约翰大学设立医科。1899年，美国长老会在广州成立夏葛女子医学校。1903年，上海成立大同医学校，1917年并入齐鲁大学医学院。1904年，耶稣会成立震旦大学，1909年迁至上海并建立医学院(1952年合并于上海第二医学院)。1904年，英美教会在济南成立共和道医学堂，1917年改组为齐鲁大学医学院。1906年，英美教会在北京联合创办协和医学堂，1915年由美国洛克菲勒基金会(罗氏基金会)及罗氏驻华医社接管，1908年，成立北京协和女子医学校；1923年合并于齐鲁大学医学院；汉口成立大同医学堂，1917年合并于齐鲁大学医学院；南京成立金陵大学医科。1909年，广州成立赫盖脱女子医学专门学校；汉口成立汉口协和医学校；1910年，南京成立华东协和医学校。
20世纪以前，教会所主持的西医教育，无论是过渡形式的教学，还是初具规模的医学校，教学格局基本类似，只是程度深浅不同而已。一般的学制为3～4年，后期增至5年。课程设置有化学、生物、物理、解剖学、生理学、内科学、外科学、产科、儿科、五官科、皮肤科和药物学，教学内容集中在生理、解剖、化学、外科和药物学，并且以实用性为主，以中国社会流行且中医较难医治的疾病为教学重点，临床教学集中在皮肤科、眼科及儿科。关于教学体制，当时受英美教学体制影响，尤其受英国爱丁堡医学院的影响最大。那时在华的许多著名传教医师如德贞、马根济等都是来自爱丁堡。中国有相当部分留学生，如最早的医学生黄宽即毕业于爱丁堡医科。这一时期中国的西医教育初具规模，开办的学校招收的学生人数不多，但其教育形式，内容和质量与欧美的教育水准相比较差距并不很大。
三、中国人自办的医学校
开设同文馆我国仿效西洋自办医学堂
清政府中的洋务派出于“欲悉各国情形，必先谙其言语文字，方不受欺蒙”的想法，于1862年(同治元年)6月在北京设立同文馆，1867年，同文馆开设“科学系”，逐渐引进西方的自然科学技术知识。1871年设立生理学和医学讲座。经美国传教医师丁韪良(MartinWAP．1827-1916)的推荐，同文馆聘德贞为第一位生理学教习。后又设立过医学班。所以一般认为，中国官办的西式医学堂迄自同文馆。然而，同文馆的医学教育最初只是讲堂讲授，没有实习。至19世纪80年代以后，改进教育方法，规定学生每周到北京教会医院实习；延聘社会上有声望的传教医师，以加强师资力量，同文馆的医学教育标准不断提高，并且逐渐系统和正规化。直至1900年八国联军入侵北京，同文馆解散，被分为二部分，即译学馆和医学实业馆，后者于1903年并人京师大学堂。
京师大学堂增设医学实业馆
鸦片战争后，改良主义者认为非变法不足以维新，便留意于教育改革。他们建议仿效欧洲建立大学，将大学的体制分为四科，医学列为第四科，教学内容为先讲解剖、生理，后论病患诊治、药物原理等。
1898年(光绪二十四年八月)德宗接受维新派的主张，创办京师大学堂。一月后，当时的管学大臣奏请:“另设医学堂，考求中西医学，即归大学堂兼辖。”德宗即刻允诺。管学大臣按照德宗的旨意，拟定了筹办管理医学堂的章程。但这个学堂并没有马上办起来，只是开设了一门医学课，聘请在同文馆任教的满乐道兼任大学堂外科和生理教习。京师大学堂后因义和团运动和八国联军的暴行暂时关闭。
1901年(光绪二十七年)德宗又敕一谕：“从前所建大学堂应切实举行”，并派张百熙为管学大臣。在京师大学堂章程概略中，在大学堂设医学实业馆(设置未定)，大学专门分科课目中，医术列于第七科，下分医学及药学两目，并规定学医者而增学拉丁文。钦定章程颁行于光绪二十七年十二月，但于二十九年即行废止。又于该年闰五月，颁布《钦定学堂章程》将大学分为八科，其中第四科为医科，分两门，一为医学；一为药学，大学分为本科及预科，医本科修业年限为3～4年，预科3年。上述拟议至1903年(光绪二十九年)始得实行。
1903年京师大学堂增设医学实业馆，于5月11日开馆招生。每月拨经费银1000两，学生最多时达33人，有教员4人，计中医内科教习1人，中医外科教习1人，西医教习1人，西医助教1人。讲授中西医学，并诊治病人。1904年医学实业馆改称医学馆。1907年，医学馆停办，将学生全部送往日本。医学馆虽然只办了4年就停办了，但为中华民国建立后创立国立北京医学专门学校提供了条件。
北洋医学堂的设立
鸦片战争后，李鸿章认识到西方科学技术的价值，提倡洋务运动，他在考察西方军事制度后，发现“西洋各国行军以医官为最重”，所以在中国海军创建之初，他就雇募“洋医”分派至各舰。继而他提出“兴建西医学堂，造就人才实为当务之急”。1881年一所正式的医学校医学馆成立，它附设在总督医院内，所以又称总督医院附属医学校(Viceroy'sHospital MedicalSchool)。定学制为4年，第一次招收8名学生，由马根济和英美驻天津的海军外科医生共同担任教学。1885年毕业时只剩6名学生，第一名学生林联辉和第二名学生徐清华留校任教，其余4名学生被分派至陆军或海军部队任军医。
1884年4月1日马根济去世后，李鸿章停止对总督医院的经济资助，医院被伦敦教会收买，医学馆由清政府接收。之后，李鸿章筹议创建较大规模的西式医院。1893年12月医院落成称天津储药施医总医院，也称天津总医院。原医学馆归天津总医院管辖，1894年6月26日李鸿章拟《医院创立学堂折》奏请设立，于本年校舍落成，正式招生开学，委任林联辉为第一任总办(校长)，以原有的医院作为实习医院，同时正式改名为北洋医学堂，这是中国第一所官办的近代西医学校。
1900年，因义和团运动而关闭。1901年李鸿章病逝，1902年袁世凯恢复该医学堂，改称海军医学堂。辛亥革命后1913年改称直隶公立医学专门学校。1915年归海军部统辖，称海军医学校。该校于1928年停办。
创办北洋军医学堂
1902年(光绪二十八年)袁世凯操练新军，在天津办了北洋军医学堂，11月24日正式成立。任命北洋候补道徐华清为总办，日本军医平贺精次郎为总教习(教务长)。学制为4年，每班40人。后在天津河北四马路新建校舍，并附设防疫学堂，由日本人古城梅溪主持，教员多为日人，课本亦用日文。这是一所日本式的医学校。1906年(光绪三十三年)由陆军军医司接收，改名为陆军军医学堂。1907年伍连德任协办(副校长)。1908年又增设药科，学制为3年。1911年，伍连德率该校学生去哈尔滨办理鼠疫防治工作，成绩显著。1912年改组，1915年迁往北京。1933年又迁往南京，改称陆军军医学校。常有二、三百人在校学习，这是我国最早设立的陆军军医学校。
四、晚清时期的留学生
西方资本主义强列认识到，要想真正实现他们统治中国的梦想，就要培养一批为他们服务的知识分子。因此，吸引留学生成为他们文化侵略的一种手段。同时，清政府为了维持其统治地位，掀起洋务运动，也开始向国外派遣官费留学生，一部分改良主义者和资产阶级革命分子，为了寻求治国救本的道路，也纷纷出国留学。因此，19世纪末，20世纪初在我国近代史上掀起了第一次留学高潮。
中国留学欧洲学医的第一人是黄宽，他是自费并得到教会医学校的赞助出国留学者。1847年1月随澳门马礼逊学校校长布朗赴美，入麻省曼松学校学习，1849年毕业后，1850年赴英国爱丁堡大学学习，1855年毕业后回国。曾任海关医官，博济医院代理院长、兼博济医校的教学。中国女子留学习医的第一人是金韵梅。她二岁时父母因染疫双亡，被美国长老会麦卡蒂(McCarteeDB．)收养，后赴美人美国纽约女子医学校学习，1885年毕业。回国后曾任北洋女子医院院长，于医院内附设护士学校，造就护士人才。
1896年中国向日本派出第一批留学生13人。此后，中国留学生赴日学习者逐年增加。1898年日本国内成立一个半官方的团体东亚国文会，通过日本驻华公使矢野文雄，向清政府提出多派青年学生赴日留学的建议，清政府总理衙门完全同意，并下令各省选学生赴日留学。1903年，管学大臣张百熙选派学生31人赴日留学，其中有3名选学医药学，他们是苏振潼(内科)、蒋履曾(外科)、王曾宪(药学)。
随着民主思想的逐渐传播，1905年(光绪三十一年)终于在“废科举、办学校、派游学”的声浪中，停止了科举，历时1200余年的科举制度至此被废除。1905年中国废除科举制度后，有大量学生赴日留学。
中日之间签订的留学生条约，引起美国统治集团中一部分人的注意。1906年美国伊利诺斯大学校长爱德蒙·詹姆士在呈美国总统罗斯福“备忘录”中提出：“哪一个国家能成功地教育这一代中国青年，哪一个国家便将由于付出的努力而在精神上、知识上和商业的影响上获得最大可能的报偿……这种道义上的影响与扩展，即使单纯从物质概念而言，意味着所付出的代价在回报时，将比任何其他方式获利更大。”1908年美国国会通过罗斯福的咨文，向中国政府正式声明，将偿付美国庚子赔款的半数，作为派遣留学生赴美之用，以后留美学生显著增加。
出国的留学生回国后，他们在各个医疗卫生机构担任重要职务，对当时的医疗卫生事业起有一定的影响作用。
