1．分子克隆常用缓冲液
2．磷酸缓冲液
（1）25℃下0.1mol/L磷酸钾缓冲液的配制※
| pH | 1mol/L K2HPO4(ml) | 1mol/L KH2PO4(ml) |
| 5.8 | 8.5 | 91.5 |
| 6.0 | 13.2 | 86.8 |
| 6.2 | 19.2 | 80.8 |
| 6.4 | 27.8 | 72.2 |
| 6.6 | 38.1 | 61.9 |
| 6.8 | 49.7 | 50.3 |
| 7.0 | 61.5 | 38.5 |
| 7.2 | 71.7 | 28.3 |
| 7.4 | 80.2 | 19.8 |
| 7.6 | 86.6 | 13.4 |
| 7.8 | 90.8 | 9.2 |
| 8.0 | 94.0 | 6.2 |
（2）25℃下0.1mol/L磷酸钠缓冲液的配制※
| pH | 1mol/L Na2HPO4(ml) | 1mol/L NaH2PO4(ml) |
| 5.8 | 7.9 | 92.1 |
| 6.0 | 12.0 | 88.0 |
| 6.2 | 17.8 | 82.2 |
| 6.4 | 25.5 | 74.5 |
| 6.6 | 35.2 | 64.8 |
| 6.8 | 46.3 | 53.7 |
| 7.0 | 57.7 | 42.3 |
| 7.2 | 68.4 | 31.6 |
| 7.4 | 77.4 | 22.6 |
| 7.6 | 84.5 | 15.5 |
| 7.8 | 89.6 | 10.4 |
| 8.0 | 93.2 | 6.8 |
※:用蒸馏水将混合的两种1mol/L贮存液稀释至1000ml，根据Henderson-Hasselbalch方程计算其pH值：
pH=pK’+1g([质子受体]/[质子供体])
在此，pK’=6.86(25℃)。
3．电泳缓冲液
测序凝胶加样缓冲液
98%去离子甲酰胺
10mol/L EDTA(pH8.0)
0.025%二甲苯青FF
0.025%溴酚蓝
甲酰胺：许多批号的试剂级甲酰胺，其纯度符合使用要求，无须再进行处理。不过，一旦略呈黄色，则应用在磁力搅拌器上将甲酰胺与Dowex XG8混合床树脂共同搅拌1小时进行去离子处理，并用Whatman 1号滤纸过滤2次，去离子甲酰胺分装成小份，充氮存于-70℃。
常用的电泳缓冲液
| 缓冲液 | 使用液 | 浓贮存液（每升） |
| Tris-乙酸（TAE） | 1×：0.04mol/L Tris-乙酸 | 50×：242gTris碱 |
| 0.001mol/L EDTA | 57.1ml冰乙酸 | |
| 100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) | ||
| Tris-磷酸（TPE） | 1×:0.09mol/L Tris-磷酸 | 10×:10gTris碱 |
| 0.002mol/L EDTA | 15.5ml85%磷酸（1.679g/ml） | |
| 40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) | ||
| Tris-硼酸（TBE）a | 0.5×0.045mol/L Tris-硼酸 | 5×：54gTris碱 |
| 0.001mol/L EDTA | 27.5硼酸 | |
| 20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) | ||
| 碱性缓冲液b | 1×:50mmol/L NaOH | 1×:5ml 10mol/L NaOH |
| 1mmol/L EDTA | 2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0) | |
| Tris-甘氨酸c | 1×:25mmol/L Tris | 5×:15.1gTris |
| 250mmol/L 甘氨酸 | 94g苷氨酸（电泳级）（pH8.3） | |
| 0.1% SDS | 50ml 10% SDS(电泳级) |
说明：
①TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物，为避免这一问题，可在室温下用玻璃瓶保存5×溶液，出现沉淀后则予以废弃。
以片都以1×TBE作为使用液（即1：5稀释浓贮液）进行琼脂糖凝胶电泳。但0.5×的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1：10稀释的贮存液作为使用液。
进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小， 故通过缓冲液的电流量通常较大，需要使用1×TBE以提供足够的缓冲容量。
②碱性电泳缓冲液应现用现配。
③Tris-甘氨酸缓冲液用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。
2×SDS凝胶加样缓冲液：
100mmol/L Tris·HCl(6.8)
200mmol/L二硫苏糖醇（DTT）
4%SDS（电泳级）
0.2%溴酚蓝
20%甘油
不含DTT的2×SDS凝胶加样缓冲液可保存于室温，应在临用前取1mol/L贮存液现加于上述缓冲液中。
4．凝胶加样缓冲液
| 缓冲液类型 | 6×缓冲液 | 贮存温度 |
| Ⅰ | 0.25%溴酚蓝 | 4℃ |
| 0.25%二甲苯青FF | ||
| 40%（W/V）蔗糖水溶液 | ||
| Ⅱ | 0.25溴酚蓝 | 室温 |
| 0.25%二甲苯青FF | ||
| 15%聚蔗糖(Ficoll400) | ||
| Ⅲ | 0.25%溴酚蓝 | 4℃ |
| 0.25%二甲苯青FF | ||
| 30%甘油水溶液 | ||
| Ⅳ | 0.25%溴酚蓝 | 4℃ |
| 40%(W/V)蔗糖水溶液 | ||
| 碱性加样缓冲液: | ||
| 300mmol/L NaOH | ||
| 6mmol/L EDTA | ||
| Ⅴ | 18%聚蔗糖(Ficoll400) | 4℃ |
| 0.15%溴甲酚绿 | ||
| 0.25%二甲苯青FF |
使用以上凝胶加样缓冲液的目的有三：增大样品密度；以确保DNA均匀进入样品孔内；使样品呈现颜色，从而使加样操作更为便利，含有在电块中能以可预知速率向阳极泳动的染料。溴酚蓝在琼脂糖中移动的速率约为二甲苯青FF的2.2倍，而与琼脂糖浓度无关。以0.5×TBF作电泳液时，溴酚蓝在琼脂糖中的泳动速率约与长300bp的双链线状DNA相同，而二甲苯青FF的泳动则与长4kb的双链线状DNA相同。在琼脂糖浓度为0.5%～1.4%的范围内，这些对应关系受凝胶浓度变化的影响并不显著。
选用哪一种加样染料纯属个人喜恶。但是，对于碱性凝胶应当使用溴甲酚绿作为示踪染料，因为在碱性pH条件下其显色较溴酚更蓝为鲜明。
5．各种pH值的Tris缓冲液的配制
| 各种pH值的Tris缓冲液的配制 | |
| 所需pH值（25℃） | 0.1mol/L HCl的体积 |
| 7．1 | 45．7 |
| 7．2 | 44．7 |
| 7．3 | 43．4 |
| 7．4 | 42．0 |
| 7．5 | 40．3 |
| 7．6 | 38．5 |
| 7．7 | 36．6 |
| 7．8 | 34．5 |
| 7．9 | 32．0 |
| 8．0 | 29．2 |
| 8.1 | 26.2 |
| 8.2 | 22.9 |
| 8.3 | 19.9 |
| 8.4 | 17.2 |
| 8.5 | 14.7 |
| 8.6 | 12.4 |
| 8.7 | 10.3 |
| 8.8 | 8.5 |
| 8.9 | 7.0 |
某一特定pH值的0.05mol/LTris缓冲液的配制：将50ml 0.1mol/L Tris碱溶液与上表所示相应体积（单位：ml）的0.1ml/L HCl混合，加水将体积调至100ml
（2）温度对50mmol/LTris·HCl液pH值的影响
| 4℃ | 25℃ | 37℃ |
| 8．1 | 7．5 | 7．2 |
| 8．2 | 7．6 | 7．3 |
| 8．3 | 7．7 | 7．4 |
| 8．4 | 7．8 | 7．5 |
| 8．5 | 7．9 | 7．6 |
| 8．6 | 8．0 | 7．7 |
| 8．7 | 8．1 | 7．8 |
| 8．8 | 8．2 | 7．9 |
| 8．9 | 8．3 | 8．0 |
| 9．0 | 8．4 | 8．1 |
| 9．1 | 8．5 | 8．2 |
| 9．2 | 8．6 | 8．3 |
| 9．3 | 8．7 | 8．4 |
| 9．4 | 8．8 | 8．5 |
（6）常用缓冲液的pKa值
| 缓冲液 | 分子量 | pKa值 | 缓冲范围 |
| Trisa | 12.1 | 8.08 | 7.1～7.9 |
| HEPESb | 283.3 | 7.47 | 7.2～8.2 |
| MPOSc | 209.3 | 7.15 | 6.6～7.8 |
| PIPESd | 304.3 | 6.76 | 6.2～7.3 |
| MESe | 195.2 | 6.09 | 5.4～6.8 |
a：三羟甲基氨基甲烷；b：N-2-羟乙基哌嗪-N’-2-乙磷酸；c：3-（N-吗啉代）丙磺酸；d：N，N’-双（2-乙磺酸）哌嗪；e：2-（N-吗啉代）乙磺酸。
7．温度对常用缓冲液pH的影响
| 缓冲体系 | pKa(20℃) | △pKa/10℃ |
| Mes | 6.15 | -0.110 |
| Ada | 6.60 | -0.110 |
| PiPes | 6.80 | -0.085 |
| Aces | 6.90 | -0.200 |
| Bes | 7.15 | -0.160 |
| Mops | 7.20 | -0.013 |
| Tes | 7.50 | -0.200 |
| Hepes | 7.55 | -0.014 |
| Tricine | 8.15 | -0.210 |
| Tris | 8.30 | -0.310 |
| Bicine | 8.35 | -0.180 |
| Glycylglycine | 8.40 | -0.280 |
