IGSS染色的半薄切片，可以在光镜下直接观察阳性结果，为电镱取阳性部位及观察打下良好的基础。环氧树脂会妨碍免疫组化染色。经过饿酸处理后固定的组织同样也会影响抗原抗体反应，因此，半薄切片作IGSS染色剂，应作以下处理。
（1）脱环氧树脂，切片以NaOH的无水乙醇饱和溶液浸泡30～60min，然后以无水乙醇洗5min，两次，再以95%，80%，70%酒精各洗5min，然后入水。
（2）经饿酸固定过的切片入1%过碘酸10min（0.5μm厚，时间可随切片厚薄增减）除去饿酸，然后蒸馏水洗5min，4次。
（3）切片用0.05mol/l TBS,pH7.4洗10min。
（4）按石蜡切片第二步往下进行。
