免疫荧光间接法用于研究人和实验动物对疟原虫感染的免疫反应，疟疾流行病学调查和临床诊断有很大的实用价值。
1．抗原标本人疟原虫标本制备：采用多种疟原虫混合抗原，制作涂片，甲醇或丙酮固定。要每个高位中视野含裂殖体总数约15个即可。或用易感猴的各种疟原虫感染的红细胞。
鸡疟原虫抗原标本制备：取感染疟原虫后第9～11天之间的鸡血制备血膜，贮于4℃或-20℃下，用前丙酮固定10min。
2．待检血清采血方法同血吸虫法。
3．荧光抗体常用抗人IgG荧光抗体。
4．检查方法待检血清以1：20起始稀释，按间接法染色，镜检。
5．结果判断阳性结果，人类疟原虫包涵体呈现明亮的黄绿色荧光。鸡疟原虫抗原主要显示胞浆染色。1：16或1：20稀释待检血清阳性时，可以继续稀释作滴度检查。低于1：20的结果无意义。用人类疟原虫多种混合抗原和单抗原，病人抗体染色效价可达1：65536，1：1024～1：4096者占1/3。以鸡疟原虫作抗原，效价最高1：640，以恶性疟最高为1：150，间日疟为1：40。
