在一个典型的PCR反应体系中需加入:适宜的缓冲液、微量的模板DNA、4×dNTPs、耐热性多聚酶、Mg2+和两个合成的DNA引物。模板DNa 94℃变性1min,引物与模板40~60℃退火1min,72℃延伸2min。在首次循环前模板预变性3~5min;在末次循环后,样品仍需继续延伸3~5min以上,确保扩增的DNA为双链DNA。为便于了解PCR反应中各成份的组成,加入量和反应条件,使人们以此为基础,对不同的研究对象逐项改变来找到最佳反应条件,特列举Perkin Elmer Cetus公司Gene Amp DNA试剂盒提供的典型反应条件供参考。
表22-1 PCR反应混合液
成分 | 加入体积(μl) | 最终浓度 |
双蒸馏水 | 53.5 | |
10×反应缓冲液[1] | 10.0 | [1×]Mg2+1.5mmol/l K+50mmol/L |
4×dNTPs(各1.25mmol/L) | 16.0 | 各200μmol/L |
λ-DNA模板(全长48.5kD) | 10.0 | 1ng/次 |
引物1,2(各25bp,20μmol/L)[3,4] | 5.0 | 1.0μmol/L(100pmol) |
Taq聚合酶储存液[2] | 0.5 | 2U/100μl |
总体积(pH8.3) | 100.0 | |
石蜡油 | 50~100.0 |
扩增条件:94℃60s,37℃60s,72℃120s,共25~30个循环。
注:[1]反应缓冲液[10×]含:100mmol/l Tris-HCl pH8.3(25℃),
15mmol/L KCl, 15mmol/L MgCl2,
0.01%(W/V)明胶(Sigma G2500)
[2]酶储存缓冲液(-20℃)含:50%甘油,100mmol/l KCl,
20mmol/L Tris-HCl ph8.0
0.1mmol/L EDTA, 1.0mmol/L DTT
200μg/ml明胶
0.5%吐温20,0.5% Nonidet P40
[3][4]引物,1,2:扩增λ-噬菌体基因中500bp的片段
引物1序列:7131~7155(5’)-GATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGG-(3’)
引物2序列:7606~7630(5’)-GGTTATCGAAATCAGCCACAGCGCC-(3’)
注意(3’)端有2个bp互补故易生成50bp的双体