ApoB48因分子量是ApoB100的48%而得名。存在于CM中，不与其他脂蛋白分子交换。ApoB48在小肠合成，是组装CM所必需的载脂蛋白。由小肠细胞分泌后进入淋巴液，并通过胸导管再进入血液循环，CM再分布到毛细血管的内皮细胞，主要是骨骼肌和脂肪组织的毛细血管内皮细胞，脂肪酶可水解CM中甘油三酯的80%～90%，剩下的脂蛋白颗粒则称为CM残粒，再送到肝脏，被肝脂酶进一步水解代谢，最后被能识别ApoE的残粒受体摄取。该残粒受体是LDL受体，还是LDL受体相关蛋白或其他蛋白质，目前还不清楚。
ApoB48在血浆中生物半寿期仅5～10min，因为分解速度很快，在血清中的浓度很低，约相当于ApoB100的0.1%。经SDS-PAGE电泳染色在VLDL组分中，仍可检出痕量的ApoB48。摄入含脂肪丰富的食物后，ApoB48/ApoB100比值明显增加。
