疾病的产生是整体功能失调、脏腑经络病理变化的反应。脏腑与经络本身就是互为络属，互为相应的。人体的经络，是全身气血往来循行的通路，它内属五脏六腑，外联官窍关节皮毛，将脏腑肢体联成统一的机体。当邪气侵入人体时，由于病的性质不同，脏腑功能，气血盛衰的不同，致使受邪的部位以及发生的症状亦有各自不同。这些症状，可以由脏腑功能异常反应出来，亦可从它们所络属的经络循行的通路上反应出来，正如《灵枢·邪客》所载：“肺心有邪，其气留于肘；肝有邪，其气留于两髀；肾有邪其气留于两辨”说明了脏腑与经络的密切关系。临床诊治过程中用脏腑，经络理论相结合辩证方法，更能察疾病之分毫，以利于疾病治疗。
从病理传变而论：脏腑经络又可分人体的内外，病理传变又有脏腑经络病变的先后之分。病在外在浅，往往病变在经在络，病在内在深，往往病变在脏在腑，秦老主张脏腑和经络辨证相结合，更能分辨疾病的部位，疾病的传变趋势以致因势利导，驱邪于外，疗疾于须臾。从治疗角度而论：临证治疗，脏腑经络一并审视，从中寻找侧重的一方，疾病在浅的属经络病，涉及面窄，诊治中可以重经络轻脏腑，有的只顺循经或局部取穴，可少考虑脏腑。而疾病在内，属脏腑病，侧重于脏腑气机、阴阳的调理，取穴偏重于俞、募、输、合、五俞母子补泻。但脏腑已涉及经络者，根于脏腑，达到病所则重取俞募而兼取郄、络。
