西藏山南地区藏医院成立于1982年，经过20多年的发展，医院从一个单一的藏医门诊发展成为如今集藏医医疗、预防、保健、康复、教学、科研、生产和销售藏药为一体的综合性民族医院。医院率先在全区同行业中争创成为了全国百家中医示范医院，率先在全区同行业中获得了二级甲等藏医院的荣誉称号。是西藏藏医学院教学医院和山南地区医保定点医院。医院先后被国家、自治区、地区授予全国民族团结进步模范单位、全国卫生系统先进集体、西藏自治区先进集体、省级“青年文明号”单位、山南地区民主评议行风满意单位等各种荣誉称号近20次。
目前全院共有132名职工，医务人员占全院职工的85%以上，其中藏医药技术人员占80%。医务人员中高级6人、中级48人；全院大专以上学历含藏医硕士研究生藏医在内共79名，藏医博士生导师2名。医院拥有加央伦珠、格桑平措、扎西次仁等一批享誉区内外的知名藏医药专家和中青年技术骨干人员56名。全院占地面积28134.37平方米，总建筑面积15300平方米，医院业务用房11610平方米，总资产达4500万元。
医院目前已开设有内科、外科、心脑血管、消化、骨伤、理疗康复、药浴保健、妇科、眼科、耳鼻喉科、口腔科等藏西结合临床一、二级科室近20个。综合住院大楼开设有藏医全科、藏西医结合、药浴康复理疗以及普外科现代手术治疗等一体化的住院病区。综合住院大楼现实际开放病床100张，拥有多种现代诊疗仪器设备。据统计，年门诊常规就诊人次6万余人。
医院依靠加央伦珠、嘎玛群旦等老藏医药专家优势，率先在全区藏医同行中成功研制了藏药原料配制技术中，技术含量最高，制药难度最大，承担风险性最高的“仁青坐台”。“坐台”称为药中之王和甘露，是配制“然那桑培”、“常觉”、“芒觉”等名贵藏药和普通藏药加“卡察”增效的必备原料，是藏药原料中的极品。20多年以来，先后成功完成了四次“坐台”的炼制，不仅填补了我地区藏医药历史上无藏药“坐台”炼制的历史空白，而且使我地区藏药炼制技术走在了全区藏医界前列。
医院申报的传统藏医“药浴”疗法与“尿诊”技术已被列为了第二批自治区级非物质文化遗产名录，其中藏医“尿诊”技术于2008年下半年进一步提升列为了国家级非物质文化遗产名录。
