日喀则地区藏医院成立于1982年，2003年国家投资1370万元，对医院进行了全面的改扩建。目前医院占地面积为11241平方米：建筑面积117864.47平方米。设有职能及临床科室13个，编制床位80张，实际开放床位100张，年门诊病人达57901人次，住院病人1183人次。现有医疗及行政后勤人员共121人，其中高级职称1名、副高职称3名，中级职称36名，初级职称68名。设有骨伤、心脑血管、胃肠、特治等专科，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、制药为一体的功能较齐全，以藏医为主、藏西医结合的综合性民族医院。
1998年被西藏自治区卫生厅纳入重点藏医院三年建设计划，2001年通过重点藏医院建设评审。2007年正式通过“二甲”评审并挂牌，2008年被西藏自治区藏医学院确定为学院定点教学医院。2009年国家投资640万元，新建了急诊理疗药浴中心。
医院注重对专科（专病）的建设，设立了消化科、骨伤科、外治科、药浴科、眼科，经过二十几年的科学研究，并在我院全区知名专家强巴赤列、朗嘉的指导下，研制出治疗乙肝新药“舒肝月光丸”，对于各种骨折、骨质疏松症及骨髓炎有一定的预防和治疗作用；外治科运用放血、火罐、针灸等藏医传统疗法，实现了藏医外治疗法在临床使用取得了很好的疗效；药浴科利用藏医传统药浴疗法，治疗各类风湿性关节炎取得突破；眼科运用现代化的诊断仪器及口服藏药、眼科综合疗法，诊治各种眼科疾病。
