蔡师治病重视脾胃的观点，源于家传，并深受许叔微、李东垣、薛立斋等医家的影响。脾胃为后天之本，水谷之海。五脏六腑非脾胃之气不能滋养，气血津液非脾胃之气不能生化，故东垣奉“脾胃为血气阴阳之根蒂”，立斋尊“胃为五脏之本源，人身之根蒂”也。蔡师亦颇重脾胃对元气精血的滋生作用。认为元气精血虽禀受于先天，由先天之肾精所化生，但必须依赖后天脾胃之气的不断滋养，才能更好的发挥作用。而二者之间，脾胃的作用是至关重要的。“盖人之始生，本乎精血之源，人之既生，由乎水谷之养。非精血，无以立形体之基；非水谷，无以成形体之壮”(《景岳全书》)。故人之自生至老，凡先天不足者，但得后天精心培育，或可弥补先天之虚而强壮；而后天之不足，若不得重新恢复其运化、滋养之功，则非但脾胃之气日虚衰，即使先天强盛之元气精血，也会因失于后天精微的调养、滋生、充实而告匮乏。基于这种认识，蔡师在临证治病中颇长于运用健脾益气之法安未病之地，以保证气血之源不竭，从而达到截断疾病进一步发展、变化的目的。如治更年期综合症，目前中医界多从肾虚论治，而蔡师认为：是病之肾气衰退仍生理性转变的大势所趋，任何治法药方终不能逆转此种衰变，人力药物所能挽者，只是减慢肾气的衰退速度，将由此引发的脏腑、阴阳失调缓冲在最小的范围内，从而达到消除或减轻症状的目的。其间，补益肾气固然重要，但调理脾胃也至为关键，基于这种后天补先天的观点，蔡师治疗本病常冶调理脾胃与补肾填精于一炉，频收良效。
从女子异于男子的生理病理言，蔡师认为：妇人以气血为本，其经带胎产的过程往往数伤于血，数脱于气，使气血常处于相对不足状态。生理状态下，脾胃可代偿性加快运化功能以弥补气血之不足，然这种负荷运化时日渐久，就易损伤脾胃功能引起病理变化；若为病理性一时大量或长期失血耗气，便可削弱或影响气血对五脏六腑的推动滋养作用，引起脏腑功能失调。脾胃为生化之源，两虚相合，形成恶性循环，导致疾病进一步发展变化。故而凡病者，必有气血不足，也必有不同程度的脾胃功能失调，治病当注重顾及脾胃，此其一也。妇人阴性偏执，易于抑郁伤肝，肝失疏泄，即可影响脾胃升降运化功能；即病之后，又多担扰、思虑、恐惧心理，而此又最易引起脾胃功能失调，使本已紊乱或不足的脾胃和气血不能修复甚至进一步加剧，导致疾病向纵深发展。固此，如何截断疾病的发展变化，脾胃功能的复旧亦是关键所在。治病当注重顾及脾胃，此其二也。治疗疾病之药物通常首先入胃，除加重脾胃受纳运化负担外，其药物偏胜之性及副作用，首当其冲的影响脾胃。如苦寒之品易败伤胃气；滋补之品易粘滞胃气；香燥之品易却夺胃阴；温热之品易燥灼胃阴；许多西药也最易引起脾胃功能的紊乱等，故如何尽量避免治疗过程中，对脾胃的损伤，对疾病的转归具重要意义。治病当注重顾及脾胃，此其三也。药物入于胃中，必须通过脾胃之受纳、运化、转输才能作用于患处，从而发挥治疗效能。若脾胃运化不佳，则其转输药物功能必会减弱，就可影响药物发挥正常作用。故凡病兼胃失调者，不论是病初、病中、病末，均当在治本却病同时，及时正确地调理脾胃，保证药物最大限度发挥治疗作用。治病当注重顾及脾胃，此其四也。凡此种种，可以李中梓喻概之：“胃气犹兵家之饷道，饷道一绝，万众立散，胃气一败，百药难施”。
本着治病当注重顾及脾胃的观点，蔡师在治病过程中，除了运用治疗疾病所需药物外，每多注重兼顾调治中州的运化功能。临床处方，部分药物习惯妙用。一则藉以改善药性之偏，一则使其焦香，增进健脾之力。而党参、白术、茯苓、甘草、半夏、石斛、谷芽、陈皮之属，为常用之品，旨在健脾和胃，以增生化之源。特别是茯苓一药，最喜用之，几乎每张处方中均遣用。蔡师言，茯苓味独甘淡，甘则能补，淡则能渗，甘淡属土，具健脾和中，利水渗湿之功，其药性缓和，补而不峻，利而不猛，既能扶正，又可祛邪，为防治脾胃之虚要药也。在蔡师自拟之“孕Ⅰ方”、“孕Ⅱ方”、“内异Ⅲ方”、“化瘀消坚方”等系列方中，均茯苓列为主药。此外，蔡师对腥臭烈气药物，如治瘀滞腹痛之五灵脂、治赤白带下之墓头回、破除症积之阿魏等药，认为有碍脾妨胃之弊，用时尤宜审慎，对脾胃失健者则应注意避免使用。
