杨氏在学术思想上对李东恒《脾胃论》推崇备至，强调健脾和胃，培土固本之法。盖“胃主受纳”，“脾主运化”，相互配合，消化水谷，吸收精微，输布全身以滋养组织器官，保证人体生长发育的需要，促进抗病机能的旺盛，因此常把脾胃相提并论，称为“生化之源”、 “后天之本”，其重要性由此可见。所以杨氏在临床治疗中对肠胃消化系统疾患，重视调理脾胃，固不待言；对其它疾病，不论情志怫郁，劳倦所伤，抑或贼风寒邪，顽痹痼疾，在辨证论治时，皆以脾胃学说为指导，疗效卓著。
曾治曹×，女，23岁，教师。患肠鸣腹泻已年余，神疲乏力，肌肤瘦削，数经治疗未效，致情绪低沉，思想若闷欲绝，特挽至亲陪同前来。诊为脾虚泄泻。嘱注意饮食清淡，起居有常，衣着保暖，劳逸有度情绪乐观，悉心治理，可望有效。处方：白扁豆衣、肉，玫瑰花均适量，煎汤代茶频饮。1周后复诊，肠鸣腹泻均有好转，精神亦见振作。乃处参苓白术散方，倍加白扁豆衣、肉及玫瑰花，煎服。2周后再复诊，病愈大半，元气渐充，原方续进，服药二月，形体康复而告愈。
盖白扁豆禀中土冲和之气而生，通利三焦，入脾胃两经，能升清降浊，和中除湿，补五脏，暖脾胃，专治脾胃虚弱，饮食不进，胸中痞满，大便不实及久泻，用以治慢性结肠炎，疗效颇佳。处方时要依性别而加引药，女用玫瑰花，男用佛手柑。查此二味，均为和中健脾之药。玫瑰花性温而气香，入肝脾二经，破积行瘀，善治肝胃气痛，为健脾和血之良药；佛手柑禀中和之性，入肺脾二经，破气消滞，善理上焦之气，进中州之食，为健脾理气之佳品。证诸古人有男女各以气血为本之说，用药因之有气血二方。男子以气为本，故用入肺脾二经的佛手柑以行气；女子以血为本，故用入肝脾二经的玫瑰花以和血。犹针灸取穴时，男用足三里，女用三阴交，同样寓有调和气血之意。而所治皆愈者，盖以李东垣脾胃学说为指导，虚实传变，都以调治脾胃为本，引经报使，贵在因人因病而施。
又治赵×，女，43岁，教师。经某医院神经科诊断为更年期忧郁症。3年来双目流泪，不能自制，当情绪激动时尤为加重。由亲友陪同来诊。杨氏诊为情志怫郁所致的“郁症”。取百会、天柱、内关、神门、合谷、足三里、三阴交、太冲等穴，内服中药归脾丸。治疗1次后心神安宁，睡寐好转，主动催促亲友同来复诊；当第3次针刺天柱时，患者自诉流泪顿止。1年宿疾，即告霍然。调治1月，诸恙告愈。
杨氏常说： “人身之脾胃，犹汽车之发动机，脾胃是供应人体生长发育所需要的营养物质的器官；而发动机则是推动车轮前进的动力，为发动机受损，则其它车与件虽完美无缺，汽车也不能开动。反之，只要发动机正常，零件的维修是较为容易的。所以以临床上必须重视调理脾胃，扶佐正气，惟元气充足，虽（疒固）疾亦易康复，若脾胃失治，元气大伤，则机体之修复为难矣。故调理脾胃，扶正达邪，为治病之根本。”语短而简，用意殊深，重在调理脾胃与治病必求于本的要旨，尽在其中。诚为李东垣《脾胃论》所说：“其治肝、心、肺、肾，有余不足，或补或泻，惟益脾胃之药为切”的意思，所以在临床上，遇肝之病用健脾疏肝法，遇心之病用健脾养血法，遇肺之病用健脾益气法，遇肾之病用健脾制水法。这些行之有效治则，都是在《脾胃论》指导下的经验大法。
