中药随着科技的不断发展，认识和应用的增多，在《中药大辞典》中收载者，已有5767种。中药品种虽繁多，来源较广泛，但其命名都有一定的来历和意义，归纳起来大致有以下几方面：
1、因功用而命名
某些药物根据其功用的特点而命名：如防风能防治外感风邪，益母草可治妇产科病，大风子治疗大麻风，淫羊藿可治阳萎，石决明、决明子能明目，续断能续筋接骨等。
2、因气味而命名
某些药物有特殊的气味，则按气味特点命名，具有芒香气味者如木香、藿香、丁香、茴香、乳香、沉香等。臭气难闻的有臭梧桐、臭牡丹、臭阿魏等。有甜味的如甘草、甘松；苦味的如苦参、苦楝子；辣味者细辛、辣椒；酸味者酸枣仁；咸味者咸秋石；淡味者淡竹叶；五味俱备者如五味子。
3、因形态而得名者
很多中药具有各种天然颜色，故其颜色亦可作命名之源。如红色者有红花、赤芍、丹参、朱砂；白色的有白芨、白芷、白术、白薇等；黑色的玄参、乌梅；黄色的有黄连、黄芩、黄柏；青色的有青黛、青蒿、大青叶等。
5、因生长特性而命名
夏枯草夏至后花叶枯萎，半夏成熟于仲夏，夏天无入夏后枯萎，忍冬之叶凌冬不凋，冬青之叶严寒尤青等都是以其生长特性作为命名之依据。
6、因入药部分而命名(药材命名中最广者)
植物药有根茎叶花果实种子之别，动物也有皮肉骨内脏之异，故其入药部分可作命名之依据，如麻黄根、葛根药用其根，苏叶、桑叶、荷叶、侧柏叶均用其叶，苏梗、荷梗、藿梗均用其茎梗，莱菔子、白芥子、牛蒡子用子而名，金银花、旋夏花、菊花、玫瑰花用其花而名之，枳实、芡实均用其果实；动物药中有刺猬皮、虎骨、熊胆、獭肝、犀角、羚羊角等名称，均以其入药部分而命名之。
7、因秉性而命名
按药物原有的性质来命名，如急性子，其性急猛异常；苁蓉补而不峻，有从容和缓之性；王不留行，走而不守；沉香性沉重，小麦性轻浮者称浮小麦等。
8、因产地而命名
如蜀椒、川芎、川贝、川楝子、川连产四川；浙江产而于杭州集散者有杭白芷、杭菊花；阿胶为山东东阿县阿井之水熬驴皮而制成；怀牛膝以河南怀庆产者佳，川贝母以四川松潘者为胜等。
9、人名命名
以人名命名大多带有传奇色彩；如使君子的命名，相传潘州郭使君疗小儿疳虫，常投此药获效；何首乌相传何姓老人常采食此药，年至130岁发犹乌黑，故名之；其他尚有牵牛子、预知子、杜仲、徐长卿、刘寄奴等。
10、外来药物及译音命名
国外或少数民族地区输入之药材，常加“番”、“胡”，如番泻叶、胡黄连、胡椒；更有译名如诃黎勒、曼陀罗、阿芙蓉等。
此外，尚有以大；小命名，如大枣、大蓟、大戟、大茴香、小茴香、小蓟；因贮久而命名如陈皮、陈仓米；药材珍贵难得或高效者，其命名常加宝，如马宝、狗宝；高效者如千年健、威灵仙等。
