在最近举办的“一代名医——祝谌予教授诞辰九十周年暨逝世五周年纪念会”上，卫生部副部长兼国家中医药管理局局长畲靖提纲挈领地概括了这位“协和名医”的一生：“著名的中医学家，中西医结合的积极倡导者。他支持创办了全国第一个在农村设立的中西医专家门诊，亲邀北京数十位名医为当地百姓诊病，十多年里自己义务出诊，分文不取，还免费为患者通信治疗，直到生命的最后一刻。”
祝老早年曾留洋日本，也是京城名中医施今墨的大弟子。他一贯主张“参形气以发微，合中西而共治”。为留下施今墨的宝贵经验，他打破了中医传统医案的编辑体例，开创性地将中西医融会贯通，拟定了以西医病名分类为纲、中医辨证为体的辨证辨病相结合的编辑方针，编著出版了第一部中医医案采用西医病名和疾病分类法先河的《祝选施今墨医案》。
祝老勇于创新还体现在他的临床治疗上。糖尿病属中医消渴范畴，历代文献均从阴虚燥热立论，三消分治着手。祝老经过系统观察，发现该病90％以上都不同程度地伴有气虚见证，从而总结出了气阴两伤、脾肾亏损才是糖尿病中医病机的规律。他又进一步发现，该病合并有血管病变者，多具刺痛、麻木、皮肤青紫、舌质紫暗或有瘀斑等血瘀征象，而使用活血化瘀中药为主治疗则可取得满意疗效，因而大胆提出了活血化瘀法结合血液流变学检测治疗糖尿病的新见解。他当年的这一理念现已被医界同行所公认和证实，并提高了中医药治疗糖尿病的疗效。同时，他还在国内首创了综合医院（北京协和医院）中医科开办糖尿病专科门诊的先例。
为使农民得到名医的诊治，1986年，祝老特意在当时的顺义县主持创办了全国第一家农村中西医专家门诊部（现北京金方国医院）。为满足广大患者的需求，时年72岁的祝老仍坚持门诊，风雨无阻，从不延误，并亲邀刘渡舟、赵绍琴、董德懋、李介明等数十位京城名医来院应诊，使京郊农民不用远行便可得到名医的诊治。祝老创办国医院并以该院为基地的“施今墨医药学术研究中”、“北京千金方糖尿病研究所”，还有另一层深意，即保存老一代名医的经验。他意味深长地对学生说：“我们老了，余年不多了，把几十年的经验带走太可惜，你们一定要抓紧时间啊！”并告诫：“要耐得住清贫和寂寞，困难再大也要保住老专家的学术经验。”
祝老在金方国医院的学生们采取了四项有助继承的措施：为门诊患者建立大病历，详细记录诊疗过程；指派学生跟随名医伺诊，师承亲授；以录像、录音设备记录名医诊疗全过程；定期举办名医讲座。现在，该院已记录了14万份名医病案、5000人次的声像病例资料以及众多医论手稿和录音讲座，为完整继承名医的经验留下了珍贵的第一手资料。
目前，祝老的学生们正在紧锣密鼓地筹办“祝谌予医药学术研究中心”，整理分类祝老的医案，深入系统研究和总结祝老的学术思想，并已确立科研课题；同时，即将出版《祝谌予全集》、《祝谌予临证用药选粹》、《祝谌予金匮讲稿》等学术著作；祝老一生最擅长的治疗糖尿病经验，不仅得到了全面继承，而且分型辨治更加深入和规范；对祝老几十年来经验结晶的独具疗效的中药方剂，也在进行制剂以及新药方面的研究与开发。
