蛋白质-能量营养不良的预后因病因、病程及严重程度和治疗的早晚而不同。绝大多数病例的病程为可逆的，经过治疗可获痊愈，无后遗症。但智力发育是否受到影响，尚难肯定。也有少数严重病例治疗无效而死亡（15～20%），儿童高于成人，男性高于女性。浮肿型患者常于入院后病情进一步恶化而死亡。消瘦型死亡的较少，时间也较晚。临床上常遇到的危险综合征如表10-15，一旦出现，应全力抢救。
继发性蛋白质-能量营养不良的预后受其原发症的影响，一旦病因消除，预后良好。
表10-15 蛋白质-能量营养不良预后的危险综合征
| 年龄小于6个月 |
| 体重/身高比值下降大于40% |
| 严重持久性腹泻 |
| 支气管肺炎或麻疹 |
| 严重眼部疾患 |
| 广泛渗出性或剥脱性皮肤疾患 |
| 广泛及深部褥疮 |
| 脱水及电解质紊乱，特别是Na、K、Mg降低 |
| 黄疸、血清胆红素及/或谷草、谷丙转氨酶明显增高 |
| 低血糖及/或低体温 |
| 血浆总蛋白低于30g·K-1 |
| 严重贫血并发临床缺氧症状 |
| 严重发跳过速、心衰及/或呼吸道症状 |
| 皮下紫癜 |
| 神志不清、昏迷 |
